(一)病因有几种病毒可引起手足口病。柯萨奇病毒最常见A16另外，柯萨奇病毒A其他植物或植物或肠道病毒也可引起手足口病。柯萨奇病毒是一种肠道病毒。肠道病毒包括脊髓灰质炎病毒、柯萨奇病毒和埃可病毒。感染部位是整个消化道，包括口腔，通过污染的食物、饮料和水果进入体内，并在肠道中增殖。
手足口病主要发生在4岁以下的儿童，但成年人也可能生病，所以可以说每个人都很容易感染。感染后，只获得该类型病毒的免疫力，对其他类型病毒无交叉免疫，即手足口病也可能再次感染其他类型病毒。
(二)发病机制
口蹄疫病毒属于小RNA病毒科，现为口泡病毒(aphoviruses)。直径为22~的球形颗粒30nm，有七种不同的血清类型：A，O，C，SATI，SATZ，SAT3?和亚洲-1类型。至少有63个亚型。不同流行区的类型分布不同，不同类型之间没有交叉免疫作用。几乎所有从人类分离到的东西都是分离的O型，偶有C类型。感染源是患有口蹄疫的动物。患病动物的血液、皮肤粘膜分泌物、唾液、尿液、粪便和牛奶都含有病毒。大多数病毒通过皮肤小伤口直接接触或挤压患病动物进入人体，偶尔通过吃受感染的牛奶、奶酪、黄油或其他乳制品，甚至吃病牛的肉和骨头。人们很难相互感染。
